
Τα ερευνητικά της ενδιαφέροντα αφορούν κυρίως την ιστορία, την επιγραφική και την τοπογραφία της Αττικής και της Πελοποννήσου από την αρχαϊκή ως και την ρωμαϊκή περίοδο.
Από το 1995 ξεκίνησε η μακροχρόνια συνεργασία της με το Κέντρο Μελετών Αρχαίας Μεσσήνης ως μέλος ομάδας επιγραφικών για το έργο των ανασκαφών της Αρχαίας Μεσσήνης της εν Αθήναις Αρχαιολογικής Εταιρείας υπό την διεύθυνση του Π. Θέμελη.
Μεταξύ των ετών 2002 και 2014 η Ανδρονίκη Μακρή συνεργάστηκε με την Ακαδημία των Επιστημών του Βερολίνου (Berlin-Bradenburgische Academie der Wissenschraften (Berlin, Germany) με σκοπό την σύνταξη λημμάτων των χορηγικών επιγραφών της Αττικής του 4ου αι. π.Χ. για την τρίτη έκδοση των Inscriptiones Graecae των μετευκλειδείων επιγραφών της Αττικής (ΙG II³). Η συνεργασία με τον εκδότη του τόμου των αναθηματικών επιγραφών Dr. Jaime Curbera, οδήγησε στην έκδοση του τόμου ΙG II³ IV 1 το 2014.
Από το 2017-είναι μέλος τριμελούς εκδοτικής ομάδας του νέου Corpus των επιγραφών της Λακωνίας (IG V 1²) το οποίο πρόκειται να εκδοθεί στην σειρά των Inscriptiones Graecae της Ακαδημίας των Επιστημών του Βερολίνου.
Από το 2005 μέχρι το 2007 η Ανδρονίκη Μακρή συνεργάστηκε με την Εφορεία Αρχαιοτήτων Μεσσηνίας για την σύνταξη καταλόγου των επιγραφών που φυλάσσονται στο Αρχαιολογικό Μουσείο Μεσσηνίας.
Από το 1989 μέχρι σήμερα είναι μέλος της Ελληνικής Επιγραφικής Εταιρείας και συμμετέχει στα ερευνητικά της προγράμματα καθώς και στην εκδοτική ομάδα του ηλεκτρονικού αρχαιογνωστικού περιοδικού ΓΡΑΜΜΑΤΕΙΟΝ www.grammateion.gr.
Το 1995 έλαβε υποτροφία από το Center for Hellenic Studies, Washington DC, ΗΠΑ. (summer scholar) με σκοπό την περεταίρω έρευνα των χορηγικών επιγραφών της Αττικής.
Το 1997 έλαβε υποτροφία από το SHELBY WHITE-LEON LEVY Program for Archaeological Publications (The Semitic Museum, Harvard University) για την μελέτη των επιγραφών του Γυμνασίου και του Σταδίου της αρχαίας Μεσσήνης. Η εν λόγω επιστημονική εργασία αποτέλεσε τη βάση για τη συνεργασία της Α. Μακρή με το Κέντρο Ελληνικών και Ρωμαϊκών Αρχαιοτήτων του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών για την έκδοση του δεύτερου τόμου των ρωμαϊκών ονομάτων της Πελοποννήσου, Μελετήματα 36, (Αθήνα, 2004).
Το 2020 έλαβε το βραβείο MGSA Grant for Innovative Initiatives για το πρόγραμμα βάσης δεδομένων ελληνικών επιγραφών Greek Inscriptions Online (GIO) το οποίο διηύθυνε https://www.mgsa.org/Initiatives/innovation.html.
Έχει διδάξει επί σειρά ετών αρχαία ιστορία και επιγραφική σε ελληνικά και ξένα εκπαιδευτικά ιδρύματα και πανεπιστήμια. Έχει συμμετάσχει με ομιλίες σε πάνω από τριάντα διεθνή επιστημονικά συνέδρια.
Makres, A. και Rhodes, P. J. (επιμ.) ΓΡΑΜΜΑΤΑ ΑΡΧΑΙΑ, Studies in Memory of Davod M. Lewis (1928-1994), Ελληνική Επιγραφική Εταιρεία Αθήνα (2024).
The Archaic Korai of the Akropolis as Aparchai and Dekatai Dedications, στον τόμο: ΓΡΑΜΜΑΤΑ ΑΡΧΑΙΑ, Studies in Memory of Davod M. Lewis (1928-1994) (επιμ. Makres, A. και Rhodes, P. J.) Ελληνική Επιγραφική Εταιρεία Αθήνα (2024), 137-163.
Archaic Inscribed Bronze Dedications on the Acropolis: Thoughts on a New Edition σε συνεργασία με την Adele C. Scafuro, στον τόμο: Hephaistus on the Athenian Acropolis. Current Approaches to the Study of Artifacts Made of Bronze and Other Metals (Eds. Papalexandrou, N. and Sowder-Koch, A., Selected Papers on Ancient Art and Architecture vol. 7, Archaeological Institute of America Boston, MA (2023) 45-66.
The Epigraphy and Topography of the Sanctuary of Machaon in Gerenia στον τόμο Transmission and Organization of Knowledge in the Ancient Mediterranean World (ed. Yoshiyuki Suto) Wien (2021) 41-54.
Victorious Athletes of Ancient Messene: Old and New Epigraphic Evidence, στον τόμο: Greek Epigraphy and Religion. Papers in Memory of Sara B. Aleshire from the Second North American Congress of Greek and Latin Epigraphy (eds. E. Mackil, N. Papazarkadas), Brill, Leiden/Boston (2021) 167-203.
Power and the People. Five Lessons from the Birthplace of Democracy, co-authored with Alev Scott, Quercus Publishing, London (2019).
Power and the People. The Enduring Legacy of Athenian Democracy, co-authored with Alev Scott, Pegasus Books, USA, (2020).
Ισχύς και Λαός, 5 μαθήματα από την γενέτειρα της δημοκρατίας, Εκδόσεις Διόπτρα, Αθήνα, (2020).
The archaic inscribed bronzes on the Acropolis of Athens: Some remarks, σε συνεργασία με την A. Scafuro στον τόμο: From Hippias to Kallias: Greek Art in Athens and beyond 527-449 BC (Eds Olga Palagia & Eliza Sioumpara), Acropolis Museum Editions, Athens (2019) 63-77.
Νέος εφηβικός κατάλογος από την αρχαία Θουρία, σε συνεργασία με την Επίτιμο Έφορο Αρχαιοτήτων Δρ. Ξένη Αραπογιάννη, στον τόμο: ΣΤΕΦΑΝΩΙ ΣΤΕΦΑΝΟΣ Μελέτες εἰς μνήμην Στεφάνου Ν. Κουμανούδη 1931-1987 (εκδ. Α. Π. Ματθαίου, Βούλα Ν. Μπαρδάνη), Ελληνική Επιγραφική Εταιρεία, Αθήνα (2019) 229-240.
The archaeology of the institution of choregia in Classical Athens: A selection of inscribed choregic monuments from the City and Rural Dionysia, Proceedings of International Scientific Conference, Thessaloniki, February 7-8 2014 in the Volume: Institution of Sponsorship from Ancient to Modern Times (ed. G. Kakavas), Athens (2019) 29-57.
Παρατηρήσεις περί της Αχαϊκής και της Ακτιακής Χρονολόγησης στην αρχαία Μεσσήνη, στον τόμο Ιερά και Λατρείες της Μεσσήνης. Από τα αρχαία στα βυζαντινά χρόνια (εκδ. Κ. Ψαρουδάκης, Μ. Σπαθή, Εταιρεία Μεσσηνιακών Αρχαιολογικών Σπουδών, Αθήνα (2017) 217-233.
Δύο ενεπίγραφα χορηγικά μνημεία από την οδό Ιωσήφ των Ρωγών 9, νοτιοδυτικά του Ολυμπιείου. Συμβολή στην τοπογραφία των Αθηνών, Αρχ. Δελτίον 67-68 (2012-2013) Μέρος Α’-Μελέτες, Αθήνα (2017) 415-421.
Θραύσμα Καταλόγου Ιερών Αντικειμένων από την Ακρόπολη, στον τόμο: ΑΞΩΝ. Studies in Honor of Ronald S. Stroud, Volume A (eds. A. Matthaiou, N. Papazarkadas), Athens (2015) 221-32.
Ἐπιγραφὲς ἀπὸ τὸν χῶρο τοῦ Ἀσκληπιεἰου τῆς ἀρχαἰας Θουρἰας, σε συνεργασία με την επίτιμο Έφορο Αρχαιοτήτων Δρ. Ξένη Ἀραπογιάννη, Ἀρχαιολογικὴ Ἐφημερὶς 154 (2015) 83-94.
Inscriptiones Graecae: Consilio Et Auctoritate Academiae Scientiarum Berolinensis et Brandenburgensis Editae. Voluminis II et III Editio Tertia, Pars IV, Fasciculus I, Pars IV. Dedicationes et Tituli Sacri, Fasciculus I, Dedicationes Publicae. Edidit Jaime Curbera, Choregicas Edidit Andronike K. Makres, De Gruyter (2014) 164-208.
Dionysiac Festivals in Athens and the Financing of Comic Performances, στον τόμο, The Oxford Handbook of Greek and Roman Comedy (εκδ. M. Fontaine, A. Scafuro), Oxford (2014) 70-92.
The Hephaistia Inscription (IG I3 82) Revisited. Στον τόμο ΑΘΗΝΑΙΩΝ ΕΠΙΣΚΟΠΟΣ, Studies in Honour of Harold B. Mattingly, (εκδ. Α. Π. Ματθαίου, R. Pitt), Επιγραφικό Μουσείο, Βρετανική Αρχαιολογική Σχολή Αθηνών, Ελληνική Επιγραφική Εταιρεία, Αθήνα (2014), 185-202.
The Sacred Gerousia in the Peloponnese: a new epigraphic document from Ancient Korone, στον τόμο, Sailing to Classical Greece, Papers on Greek Art, Archaeology and Epigraphy Presented to Petros Themelis (εκδ. καθ. Ο. Παλαγγιά και Hans Rupprecht Goette), Oxford (2011) 70-78.
A New Fragment of a 4th c. B.C. Athenian Treasure Record, Studies in Greek Epigraphy and History in Honour of Stephen V. Tracy, (εκδ. καθ. G. Reger, καθ. F. Ryan, καθ. T. Winters), Bordeaux (2010) 63-71.
Α Νew Ephebic Lampas Dedication from Athens and Ag. Inv. No. I 6577 Revisited. ΦΙΛΑΘΗΝΑΙΟΣ. Τιμητικός τόμος για τον καθηγητή Michael Osborne, (εκδ. Α. Τάμης, S. Byrne), Αθήνα (2010).
The Atarbos Base from the Akropolis of Athens Revisited (MA 1338=IG II2 3025), Αττικά Επιγραφικά, Μελέτες προς τιμήν του Christian Habicht, (εκδ. Α. Θέμος, Ν. Παπαζαρκάδας), Αθήνα (2009) 217-237.
Unpublished Ephebic List in the Benakeion Museum of Kalamata, στον τόμο: Greek History and Epigraphy. Essays in honour of P. J. Rhodes (εκδ. Lynette Mitchell, Lene Rubinstein), Wales (2009) 185-200.
On the Spartan Εirenes (Herodotus IX, 85 Iρέες η Iρένες?) στον τόμο: Sparta and Laconia from Prehistory to Premodern (εκδ. W. G. Cavanagh, C. Gallou, M. Georgiadis), British School at Athens Studies 16, London (2009) 187-194
The Rediscovery of IG I³ 253-4, στον τόμο: Αττικαί Επιγραφαί, Πρακτικά Συμποσίου εις μνήμην Adolph Wilhelm (εκδ. A. Π. Ματθαίου). Συμπόσιο που διοργάνωσαν το Αυστριακό Αρχαιολογικό Ινστιτούτο, το Επιγραφικό Μουσείο, η Ελληνική Επιγραφική Εταιρεία, Αθήνα (2007) 123-140.
Συνεργάτης στον τόμο Roman Peloponnese II, Roman Personal Names in their Social Context, (εκδ. Α. Δ. Ριζάκης, Σ. Ζουμπάκη, Κ. Λεπενιώτη) Μελετήματα 36, Αθήνα (2004).
The Sophronistai of Aixone (IG II² 1199), στον τόμο: Lettered Attica. A Day of Attic Epigraphy (εκδ. D. Jordan, J. Traill), Canadian Archaeological Institute (2003) 78-84.